Flexbox の子要素にインライン要素(span とか a タグ)を使用する事があって、
主要ブラウザの確認では特に問題なかったので普通に使えるんだろうと思ってましたが、
iOS8 や Android4.2 以下辺りではその子要素が消えてしまうようで..勉強不足でした..><

子要素に対して、 display: block; を入れて解決でした。
inline-block でもいいのかな。